MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Aklavik117 plasmid p2HPAKL117

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019562	CTTTT	2	10	20	29	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_019562	TGA	2	6	46	51	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019562	TGA	2	6	55	60	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019562	A	6	6	169	174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019562	T	6	6	191	196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019562	T	6	6	446	451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019562	T	7	7	647	653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019562	ATA	2	6	657	662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019562	T	6	6	677	682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019562	ACA	2	6	724	729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019562	TGA	2	6	789	794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019562	A	6	6	838	843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019562	A	8	8	902	909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019562	CCAA	2	8	934	941	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_019562	A	7	7	940	946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019562	A	9	9	949	957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019562	G	7	7	983	989	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019562	TAC	2	6	993	998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019562	C	7	7	1003	1009	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
20	NC_019562	T	6	6	1049	1054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019562	AAT	2	6	1060	1065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019562	A	6	6	1072	1077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019562	ATT	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019562	ATT	2	6	1106	1111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019562	A	6	6	1262	1267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019562	G	7	7	1271	1277	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019562	A	6	6	1396	1401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019562	T	7	7	1409	1415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019562	T	6	6	2123	2128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019562	ACA	2	6	2170	2175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019562	TGA	2	6	2235	2240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019562	A	6	6	2284	2289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019562	A	8	8	2348	2355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019562	CCAA	2	8	2380	2387	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_019562	A	7	7	2386	2392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019562	A	8	8	2395	2402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019562	G	7	7	2428	2434	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019562	TAC	2	6	2438	2443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019562	C	7	7	2448	2454	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40	NC_019562	T	6	6	2494	2499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019562	AAT	2	6	2505	2510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019562	A	6	6	2517	2522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019562	ATT	2	6	2542	2547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019562	ATT	2	6	2551	2556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019562	A	6	6	2707	2712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019562	G	7	7	2716	2722	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019562	A	6	6	2841	2846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019562	T	7	7	2854	2860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.